Кафедра была основана в 2006 году в составе механико-математического факультета и именовалась кафедрой вычислительной математики. В 2016 г. кафедра вошла в состав Высшей школы электроники и компьютерных наук и была переименована в кафедру вычислительной математики и высокопроизводительных вычислений.
В 2021 году кафедра переименована в кафедру математического обеспечения информационных технологий.
Кафедра ориентирована на разработку математического и алгоритмического обеспечения информационных технологий в области сбора, накопления, обработки и анализа данных, необходимых для получения информации нового качества о состоянии объектов, систем, явлений или информационных продуктов, на исследованиях теоретического характера, а также на разработки, связанные с методами численного решения прикладных задач.
С 2017 году на кафедре осуществляется подготовка магистров по направлению 09.04.01 «Информатика и вычислительная техника», профиль «Анализ данных и методы искусственного интеллекта». В 2019 открыта программа подготовки бакалавров направления 09.03.01 «Информатика и вычислительная техника», профиль «Обработка данных и методы искусственного интеллекта», а также аспирантов по направлению 09.06.01 «Информатика и вычислительная техника».
Образовательные программы предусматривают обучение современным методам обработки и анализа данных, которые необходимы для успешной реализации выпускников в профессиональной деятельности в области IT-технологий, разработки интеллектуальных и экспертных систем, анализа цифрового контента, методов искусственного интеллекта.